通常fasta文件用N来表示重复序列(用小写的atgc也很常见),下面的代码就是找出fasta文件中用N标记的区域。
首先导入biopython包,然后用SeqIO.to_dict()函数把fasta文件的记录转换成python字典...
Tag Archives: fasta
python: find repeat masked intervals in fasta files
August 10, 2009 – 6:36 PM
通常fasta文件用N来表示重复序列(用小写的atgc也很常见),下面的代码就是找出fasta文件中用N标记的区域。
首先导入biopython包,然后用SeqIO.to_dict()函数把fasta文件的记录转换成python字典...